Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD300CQ08708 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms