Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL16A1Q07092 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COL16A1Q07092 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms