Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP4Q07065 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP4Q07065 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms