Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC9Q06265 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms