Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms