Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID5AQ03989 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID5AQ03989 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms