Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PLOD1Q02809 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PLOD1Q02809 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms