Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms