Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CLTCQ00610 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLTCQ00610 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms