Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC42EP1Q00587 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms