Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXC5Q00444 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms