Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HBBP68871 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HBBP68871 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HBBP68871 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HBBP68871 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HBBP68871 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms