Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPM4P67936 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPM4P67936 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPM4P67936 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TPM4P67936 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TPM4P67936 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms