Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GNB1P62873 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GNB1P62873 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms