Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RHOBP62745 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms