Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RPS16P62249 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RPS16P62249 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RPS16P62249 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS16P62249 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS16P62249 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS16P62249 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS16P62249 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS16P62249 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPS16P62249 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms