Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVFRD-1P60508 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms