Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RIPK4P57078 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms