Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATXN1P54253 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATXN1P54253 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms