Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRAP54198 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRAP54198 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRAP54198 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIRAP54198 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIRAP54198 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HIRAP54198 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms