Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLK1P49759 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms