Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NESP48681 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
NESP48681 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
NESP48681 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
NESP48681 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NESP48681 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NESP48681 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NESP48681 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NESP48681 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC33.76■■■■□ 3
NESP48681 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NESP48681 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
NESP48681 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NESP48681 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NESP48681 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NESP48681 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NESP48681 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NESP48681 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms