Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NRIP1P48552 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NRIP1P48552 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms