Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GJA8P48165 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GJA8P48165 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GJA8P48165 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GJA8P48165 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GJA8P48165 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GJA8P48165 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA8P48165 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA8P48165 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJA8P48165 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms