Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NKX2-1P43699 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms