Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA2P42262 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIA2P42262 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms