Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KDM5CP41229 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KDM5CP41229 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms