Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms