Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKARP32238 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKARP32238 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKARP32238 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKARP32238 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKARP32238 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCKARP32238 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms