Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXA13P31271 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms