Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
CLIP1P30622 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLIP1P30622 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms