Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPIFP30405 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPIFP30405 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PPIFP30405 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPIFP30405 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPIFP30405 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPIFP30405 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPIFP30405 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPIFP30405 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms