Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC27P30260 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC27P30260 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC27P30260 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC27P30260 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC27P30260 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC27P30260 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC27P30260 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms