Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD40LGP29965 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms