Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DUSP1P28562 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms