Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HLA-DMAP28067 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms