Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABRR1P24046 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms