Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EPHA1P21709 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms