Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD33P20138 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CD33P20138 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD33P20138 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD33P20138 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms