Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXB4P17483 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms