Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMPD1P17405 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMPD1P17405 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms