Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DSPP15924 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DSPP15924 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DSPP15924 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms