Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL2P13500 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL2P13500 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL2P13500 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL2P13500 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms