Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
VPREB1P12018 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms