Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC1P11047 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAMC1P11047 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms