Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HKR1P10072 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms