Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PGA3P0DJD8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms