Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VIL1P09327 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VIL1P09327 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIL1P09327 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VIL1P09327 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VIL1P09327 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VIL1P09327 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VIL1P09327 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms