Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRCP08575 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRCP08575 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
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