Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms